У процесі гри Майнкрафт зомбі 2 ти будеш керувати не звичним чоловічком, а зеленим будинків, що вибухають монстром – крипером. Історію його появи на поверхні землі пропонується подивитися перед стартом іграшки. Суть же в неї одна – виживати. Час від часу біля голови кріпера з'являються підказки, які натякають на майбутні події або необхідні дії.
.